Dard, uma coisa que pode lhe ajudar nesse trabalho é desindexar ou páginas de Tags ou páginas de Categorias, utilizando o plugin All in One SEO Pack.
Quanto ao possível conteúdo duplicado entre posts e tags, acho dificílimo isso acontecer, principalmente se você colocar apenas o resumo dos artigos nas páginas de tags. Isso também irá evitar problemas futuros, ainda mais se as páginas de Tags forem indexadas e tiverem poucos posts nela (o que aumenta a igualdade dos conteúdos).
Espero ter lhe ajudado e boa sorte!