Há um códigozito que mete-se no index.php que faz com que os posts de determinada categoria não apareçam...
O código na minha homepage tá assim:
<?php if (is_home()) { $page = (get_query_var('paged')) ? get_query_var('paged') : 1; query_posts("paged=$page&cat=-22,-79"); } ?>
<?php if (have_posts()) : ?><?php while (have_posts()) : the_post(); ?>
Vê lá se consegues adaptar e meter no teu ; )
Trocas o -22 e -79 pelos ID's da categoria(s) que queres remover da homepage.