Isso normalmente é pago com algum cartão. Tipo Visa/Master card, etc...
Pela minha experiência, em termos de taxas, não se paga nada de especial. O cartão que tenho senão me engano pago uns 5 centimos.. de taxa.. por dominio. Acho que é isto...
Não sei se isto depende dos bancos, o meio a pagar.