Eu já experimentei quase todos e fico-me pelo magento. Tomato Cart tambem gostei mas ainda está muito verde e volta e meia lá vem o belo bug.
No inicio fugi um pouco do magento, parecia-me ser uma grande dor de cabeça para iniciantes, mas depois de insistir fez-se luz e hoje recomendo a todos. Se estás no inicio prepara-te para marrar uns dias, mas o resultado final é muito satisfatório.
Depois com imensidão de tutoriais que encontras por aí, as coisas ficam mais facilitadas. Mas também tens Prestashop que é muito acessível.
Qualquer dúvida pergunta.