Eu muito sinceramente ainda não me "debrucei" sobre o CloudFlare (mas pretendo fazê-lo, pois parece ser bastante interessante e com muitas vantagens), mas pelo o que penso tens de alterar os nameservers no teu domínio, fiz um whois ao teu domínio e não encontrei lá nenhum NS da cloudflare, se já o fizeste provavelmente terás de esperar pela propagação e sendo assim a informação ainda não está a passar pelo cloudflare fazendo dessa forma a informação que puseste no .htaccess inútil (por enquanto).
Agradeço que me corrijam se estiver errado.