Pessoalmente acho que se deve utilizar os acentos assim como os "ç" nos logótipos, não tem qualquer relação, porque se o site ou projecto tem um nome o logótipo deve ter o respéctivo nome corretamente escrito e da forma que o designer do mesmo consiga jogar melhor com a situação. Imaginem que tinham de fazer uma linha gráfica para esse mesmo projecto, iam colocar em envelopes, cartões de visita, etc por exemplo e pegando no projecto do Victor "espaco design", quem visse aquilo ficava ainda mais cnfuso, apenas os mais leigos teriam esse tipo de confusão entre o logótipo e o domínio, porque há anos que estamos habituados a utilizar domínios sem acentos, e poucos sabem que existem com acentos e mais raro é encontra-los.
Outro exemplo seria se fossem registar uma marca mista com o nome ex.: "Açucar para Você", no logótipo não poderia dizer "Acucar para Voce", que sentido fazia?
Temos o exemplo deste fórum, alguém alguma vez digitou maistráfego.pt? Provavelmente não e no entanto o acento está no logótipo.
Deixo aqui alguns exemplos desenvolvidos por mim: