Se a loja é para poucos produtos e queres destacar esses produtos nos motores de pesquisa o woocommerce é vantajoso a nível de seo por ter de fundo uma boa base de funcionamento, mas se for para ter um leque de produtos mais alargado não é recomendado porque se torna muito lento e consome muitos recursos (isto tendo em conta que terás instalados diversos plugins de funcionalidades e melhoras).
O prestashop, magento e opencart são outras opções boas, o melhor é analisar cada uma para ver qual se adapta melhor ao que precisas.
Todas as plataformas em pleno funcionamento precisam de bastantes recursos de alojamento, a nível de processamento, de RAM, de entradas sql, etc. Muitos alojamentos ditos ilimitados tem ocultas limitações neste tipo de recursos, por isso é melhor escolher com cautela.
Boa sorte para o projeto.