Então basicamente só pago o iva sobre o valor de venda final. A diferença é que terei que "adiantar" parte dele no momento em que a mercadoria entra em Portugal, certo?
Não, é precisamente o contrário. Pagas iva ao comprar, mas recuperas ao vender (enquanto o produto está na tua posse sem vender quem está arcar com o iva és tu, vais recuperar ao vender), havendo a possibilidade de teres que pagar a diferença do valor do iva na venda em relação à compra. No exemplo que te dei, pagas iva de 100€ na compra do produto e depois ao vender vais cobrar ao cliente o valor do produto sem iva + a tua margem de lucro + iva da totalidade. Como o iva do produto ao somar a tua margem de lucro vai ser superior ao que pagaste na compra do produto, podes vir a ter que pagar a diferença, dependendo do tipo de contabilidade que tenhas e também do volume de negócios. O iva é sempre do estado e é obrigatório cobrar iva em transações económicas de bens e/ou serviços que se realizem em território nacional, salvo em raras excepções que podes consultar com o teu contabilista porque dependem de diversos fatores.