olá amigo você está usando algum plugin de importação em massa ou criando os posts individualmente, pois eu possuo o mesmo tema que o seu e fiz um teste, inclusive com o mesmo vídeo do seu post, inserindo o embed tanto no campo destinado para códigos de vídeos na página criação do post quanto no corpo do post, e não tive este problema o vídeo se ajusta perfeitamente de acordo com o tamanho da tela, qualquer coisa dá uma olhada neste post:
http://nichoadulto.com.br/novavideo-wordpress-theme/Outra coisa eu tinha uma outra versão deste tema e o mesmo não ajustava os vídeos embedados corretamente .