Os bots dos motores de busca andam nos fórums , não nas bases de dados . .
E quanto a compatibilidade
Os bots andam pelo html. Nas tags de inserção do swf em html é possivel colocar dados. Por exemplo se não existir o flash plugin podes colocar uma mensagem.
A compatibilidade não é obrigatoriamente um problema desde que se use um plugin mais antigo (o ie 6 já traz por norma um plugin flash, não sei qual a versão).
Poderá ser um problema o peso do ficheiro swf a fazer download inicialmente.
Cumps