Além dos serviços que o feedburner te disponibiliza é mais um site com backlinks para os teus artigos, não que tenha o mesmo valor de um link noutro blog por exemplo, pois o feedburner é da google e o algoritmo está preparado para distinguir o que é uma feed, o google dá extremo valor aos blogs, principalmente do blogger e wordpress, e digamos que ter conta no feedburner é mais uma maneira de o bot te identificar e teres mais um site a linkar para o teu, além de te distinguir como blogger, tal como usares o analytics ou o webmaster tools...
Logo a diferença é muita, um feed normal não passa disso um feed para os users te poderem seguir através dos leitores de feed...