Sclabisweb nunca tinha ouvido falar, nem parece ser uma empresa... E o mercado dos gameservers é reconhecido como um mercado de putos que alugam um vps e metem-se a alugar servidores de jogos...
Para esclarecer alguns pontos, os domínios .com.pt são livres, qualquer pessoa pode registar, porque raio uma empresa iria comprar um .com.pt se pode registar um .pt? É quase demonstrado que em .com.pt não é empresa... Em relação aos domínios .pt não são só para empresas, qualquer pessoa pode registar uma marca e registar domínio .pt, considerar se é uma empresa ou não só por ter domínio .pt está errado.
O Isento de IVA vale 0, é obrigatório passar factura, tenha IVA ou não!
No entanto o maior problema está em como falas, demonstras total desconhecimento sobre assuntos de contabilidade e legais, apresentas a (pseudo)empresa e depois falas que os clientes é que vão pagar o servidor, eles não são teus sócios, os teus custos são independentes dos custos dos clientes, não vais dar a factura do servidor aos clientes, nem a podes rasgar e dar um bocado a cada cliente...
Boa sorte, mas na minha opinião não estás a ir pelo melhor caminho...