Primeiro tens de criar um ficheiro em branco com o nome que te dão quando carregas em Get Ad Code e escolhes o cms ou linguagem de programação... será algo do tipo: local_5##30.xml
e colocas na raiz do servidor ou do sistema que usas.
Depois, não sei ao certo como funciona o e107, mas se puderes criar modulos (ou blocos...) com php colas lá o código que te dão, se não puderes vai ao template e põe lá no local que queres...