Olá, galera! Voltando a postar por aqui...
O que tem peso é os backlinks de sites relacionados com o tema do nosso, que tenham peso nas SE. Ora sites que apenas apontam para outro não têm valor, logo não estão a passar nada, hoje em dia não têm qualquer peso ou relevância em termos de SEO o que queres ou estás a fazer...
Primeiramente, Nuno, gostei muito do que disse. É fácil manter a linha de pensamento, R.A.: para otimizar o SEO de seu blog, você precisa de links em locais "fortes" e que o Google "goste". Assim, se seus domínios nem são indexados no Google, têm PR0, sem conteúdo e sem links apontando para tais, é claro que pode ter a certeza de que nenhuma relevância ou vantagem em relação ao SEO pode ser adquirido.
Agora, vamos à minha opinião acerca de sua pergunta:
Agradeço a V.colaboração.
Pelo que percebi em termos de SEO, não existe grandes opções a um site em flash que não sejam a obtenção de back links. Claro que os dominios poderão ser uma opção, mas em principio devem encaminhar todos para o mesmo site, é essa a minha grande dúvida no momento, manter os dominios com as páginas ou eliminar as paginas, mantendo os dominios a fazer redirect para o site principal! 
Primeiramente, já lhe indico que pense com carinho na alternativa de retirar o esquema de seu site em flash e optar por algo mais SEO-friendly. Como sempre, recomendo o WordPress.
Na questão do que fazer com os domínios e as páginas que estão neles, penso que a melhor alternativa é realmenet retirar a página que está a linkar e fazer um redirect 301 direto. Não só do ponto de vista de SEO, mas também de usabilidade: ninguém gosta de clicar duas vezes para alcançar uma página.
Entrando um pouco mais a fundo em SEO, reforço o que alguns amigos disseram logo acima, mas com um ponto de vista diferentes: para mim, você tem
3 alternativas:
1. Transformar estes domínios em Doorway Pages de qualidade e fazer valer a pena. Para isso, você terá que jogar estes domínios em IP's diferentes, criar um conteúdo original e diferenciado para cada uma (que tenha relação com o site principal) e começar a fazer um esquema de Link Building para tais. Posso dizer que, por experiência própria, a técnica pode ser muito eficiente se bem utilizada. Porém, todo cuidado é pouco.
2. Apenas fazer um Redirect 301 e tentar criar um pequeno Link Building em torno de cada domínio para, pelo menos, colocá-los nos buscadores. Isso irá fazer com que você consiga indexar pelo menos em alguns poucos resultados de busca se for algo pouco competitivo. Assim, pode angariar algumas boas visitas por tais buscas, que só aparecerão se seus domínios realmente estiverem indexados nos motores de busca. Só não tenho certeza se o Google irá indexar os domínios se fizerem propriamente um redirect 301 para o domínio principal. Para responder isso, peço a ajuda dos amigos do +T.
3. Abandonar de vez esses domínios. Explico o porquê: com certeza, como já disse, atualmente eles não estão lhe rendendo nada do ponto de vista de SEO e nem em retorno de visitas, pelo o que percebi. Assim, existem inúmeras outras técnicas que pode aplicar ao invés de gastar o seu tempo tentando fazer algo com os domínios. A primeira vista, o Article Marketing é uma delas: você conseguirá links relevantes com textos simples e, de quebra, em outros IP's e em sites que já tem um PageRank considerável e coisa do tipo. Eu costumo recomendar Doorway Pages apenas em esquemas onde todas as outras técnicas já foram utilizadas e elas são um adicional. No seu caso, creio que ainda pode aplicar SEO On Page e Link Building de outras maneiras antes de optar por realmente direcionar domínios, coisa que acaba sendo muito complicada.
Enfim, estas são minhas recomendações à você, R.A. Se ainda não conhece o Article Marketing, aproveito para deixar exposto o conteúdo do Análise sobre o assunto, que pode conferir aqui:
http://www.analiseblogueira.com/tag/article-marketing/Espero ter lhe dado uma esclarecida boa!
Um abração e muito sucesso com seu(s) projeto(s)!
