Bem, já consegui que envie os mails para resetar as passwords.
Em principio apartir daqui já deve estra tudo bem, tirando os avatars e as passwords têm que ser todas resetadas.
Sempre é preciso colocar o código:
$config = new JConfig();
$mosConfig_db = $config->db;
$mosConfig_dbprefix = $config->dbprefix;
no configuration.php do Joomla.
Obrigado pela ajuda que me deste!
P.S. só uma coisa, sabes como posso apagar os prefixos que criei na BD?
Obrigado
Cumps