Problema ResolvidoFica aqui para quem tiver problemas destes, quando é uma loja em euros é tudo sem problema, taxas todas certinhas e não há destes problemas.
No caso das moedas que temos de adicionar manualmente, por vezes existem erros na atualização da "conversão", neste caso a conversão do real estava errada, mesmo que todas as outras moedas esteja inativas, a base é o dólar.
Como resolvi:Fui em Moedas, coloquei a a conversão do dólar e do BRL para "1", e pronto, já não existe alteração de valores.
Deixo aqui o tópico caso mais alguém necessite de ajuda nisto, afinal era facil
*Se usarem múltiplas moedas não façam isto obviamente, se não o "número" será sempre o mesmo embora o valor seja bem diferente, nesse caso coloquem as taxas de conversão certas