alterei a opção em que se define a que pais se destina o site, pus Portugal. Não sei se influencia ou não mas 3 semanas depois o site que estava em primeiro para uma determinada keyword no google.pt desapareceu das pesquisas e se pesquisar essa keyword e seleccionar a opção "apenas páginas de portugal" ele aparece na primeira página...
Deduzo que tenha sido da opção.