Estas a usar o WordPress 3 com o multisite ou versão antiga do MU?
É que no 3 isso fica tudo guardado na mesma base de dados (no outro não sei, mas deve ser igual) portanto qualquer plugin de backup deve servir, penso que existem vários, procurar por backup na parte de plugins do WP que encontras o que há e escolhes o melhor para ti.
Mas se for uma cena pontual, podes facilmente usar o phpMyAdmin e fazer tu manualmente.
Ah, e a função própria (Import/Export) do WordPress, não serve para o que pretendes?